12月初一名浙江台商回台確診，發現他和另一位德籍確診者，同住一間防疫旅館，但旅館人員和環境採檢都是陰性，但明明兩人從不同國家來台，病毒的基因定序卻相似，屬於同系列的毒株，台大兒醫院長黃立民認為，病毒基因相似能看出是群聚事件，不能排除兩人是在防疫旅館間接感染。
不斷強調已經結案，但到底是不是互相傳染，陳時中不願多談，12月初案719浙江台商，住在防疫旅館3樓，案693德籍男子住6樓，兩人重疊五天的時間，都住在同間防疫旅館，指揮中心一度以，防疫旅館沒人確診為由，認為台商是在機場感染，隔天卻改口找出案693，沒想到兩人基因定序還相似。
台大兒醫院長 黃立民：「如果他們兩個的基因定序很相似，甚至是相同的話，代表他們是同個傳染鏈，或者同一個群聚事件，旅館可能的傳染途徑，通風啊或者是動線。」
黃立民強調病毒基因相似就是群聚，也讓感染源更加撲朔迷離，因為明明14位防疫旅館人員，PCR採檢和抗體都是陰性，為求謹慎就連房門把馬桶，空調出風口和樓梯間一併採檢，結果也都是陰性，旅館雖沒大爆發感染，病毒比對出來卻是同系列，專家認為不能排除，兩人在防疫旅館間接感染，更有可能是氣融膠惹禍。
台大兒醫院長 黃立民：「會不會有其他的房客，其實是房客進去過，他只住了一兩天，或者怎麼樣，或者有些工作人員，其實是暫時員工。」
明明一個從大陸入境，另一個從歐洲德國來台，結果卻是基因鍊相似，更何況又同住一間防疫旅館，專家說不無可能在旅館內染疫，雖然已經結案，但勢必讓所有防疫旅館的管控，更加繃緊神經。
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