中研院內部最近發起連署，要向馬總統告狀，這是因為日前通過的公務人員行政中立法，限制公務人員參與政黨活動，而中研院這些具有公務員身分的學者，大喊侵犯人權，一狀告上總統府，大動作反彈。
「同仁們！你犯法了！」，中研院週報砲轟公務人員行政中立法，矛盾又違反人權，過去像中研院研究員吳乃德，多次公開倒扁。中研院研究員吳乃德(95.09.09)：「期待(陳水扁)總統慎重考慮辭去職務。」
吳乃德也痛批公投綁大選。吳乃德(96.11.3)：「總統有沒有資格或權限(提出公投)。」
或是像瞿海源參與民進黨舉辦的國事會議，在6月行政中立法通過施行，現在通通不可以，38位中研院研究人員跳出來連署表達反對，認為限制公務員站台、連署，保障政治性更強的參選行為，實在自相矛盾。
學者入閣挺政策不犯法，在野學者提批評卻違法，那麼過去胡適支持雷震組黨、傅斯年批評共產黨，都是非法行為。考試委員黃俊英：「對這些公務人員他的一些言論或行為，他有一些合理的規範，那他並不會說會影響，他目的不是在限制人家的言論自由，既然大家有這些疑慮，本來這個法律就有再研商的空間。」
銓敘部強調，行政中立法並沒有限制公務員加入政黨，以及下班時間所參與的政治活動，只是法令適用對象範圍模糊、解釋不夠清楚，中研院已經決定串聯院內學者專家研議，向馬總統告狀。
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