對於生死，聖嚴法師早就參透，早在2004年就已經預立遺囑，當中提到，身後事絕對不能舖張浪費，力求儉約，要求不發訃聞、不築墓也不立碑，選擇回歸大自然的植葬；但即使對於生死能夠平靜面對，聖嚴法師還是有個遺願，就是沒辦法在生前，親眼看到法鼓大學正式成立。
聖嚴法師不敵病魔病逝，享壽80歲，但對於生命他早就參透，遺言中瀟灑提到，「無事忙中老，空裡有哭笑，本來沒有我，生死皆可拋」，就是聖嚴法師，用來開示大眾，人人都是過客，沒什麼好計較！
法鼓山現任方丈果東法師：「我身前無任何資產，一切財物涓滴來自十方佈施，故悉歸屬道場。」
一生困頓，聖嚴法師務求儉約，2004年就立好的遺言更是交代，「身後不發訃聞、不傳供、不築墓、不建塔、不立碑、不豎像、勿撿堅固子(舍利子)，告別、植葬等儀式，勿鋪張浪費」，對於生死，即使聖嚴法師態度泰然，但過世前，一直無法等到法鼓大學正式成立，是他最大遺願。
法鼓大學董事鄭丁旺：「我最後一次(1/18)看到師父的時候，跟我談到法鼓大學未來的發展，整整談了一個多鐘頭，那個時候他已經精神(不佳)，住院臨時請假出來的，就很奇怪他那兩天，非常亢奮非常好。」
如今聖嚴法師大體，將暫置法鼓山大殿中，2月4日開放信徒弔唁，24小時報恩念佛，6日舉辦入殮儀式，8日遺體進行荼毘大會，也就是火化，15日骨灰植葬在環保生命園區內，長眠在他一手創立的法鼓山。
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