特偵組追查機密外交案，發現拉美專案的經費流向可疑！知情人士向週刊爆料，當初簽名領走拉美2千萬美元的，疑似是前台灣人公共事務會FAPA會長吳明基；由於領取過程違背撥款程序，最後錢又流入台灣10多個人頭帳戶，檢方懷疑這起機密外交案大有問題。
前國安會秘書長邱義仁主導的機密外交，除了安亞案的50萬美金，拉美專案的2千萬美金流向也大有問題！
有知情人士向週刊爆料，當初2千萬美元的領據上簽有吳明基三個字，但是否由他親自簽名，還是有人假造他的名義來簽就不得而知，最後這筆錢沒有進到吳明基手上，而是存入台灣10多個人頭帳戶。
其中包括前台灣週刊採訪主任陳宗逸，而他的伯父就是前FAPA執行長陳文彥，特偵組去年12月17日發動第十波搜索，檢方質疑，為何拉美專案經費，沒有任何正式文件和報告，吳明基領取也完全違背機密外交撥款程序。
91年到94年間，吳明基擔任FAPA總會長，出身南投縣，取得美國化學博士，他台獨立場鮮明、和陳水扁互動密切，卸任後，還被陳水扁延攬回台，擔任工研院副院長和生技開發中心執行長，只是鞏固外交的經費，怎麼會由他領走、又轉回台灣私人帳戶，檢方正試圖解開這謎題。
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