從9月1日開始，住院醫師納入勞基法，每四週總工時不得超過320小時，預計約有4680人適用，醫師勞權提升可望改善目前過勞處境，不過醫界直言恐怕落實不易，而且因工時控管造成的值班人力缺口，可能轉嫁到主治醫師身上。
專業醫師的養成，是一條漫漫長路，考上醫師執照後，就需要到教學醫院，進行4到6年的住院醫師訓練，學習看診、手術累積臨床經驗，才能取得專科醫師考試資格成為主治醫師，但因為住院醫師年輕又有學習需求，往往是醫院中最耐操的勞動力。
台灣外傷醫學會理事長簡立建：「的確他要負責起很多醫院基層一線的工作、臨床的照顧，那主治醫師有時候要看門診，但是很多病房的工作尤其是我們外科系的，一些值班病人一些臨時狀況處理都要靠住院醫師來解決。」
台灣外傷醫學會理事長簡立建：「當年就是所有都是你要負責，類似一個責任制的工作，所以我在總醫師階段就是1、2年都是我值班，只要能夠找到你你還活著你就會接電話，但我覺得這長久來並不是個很好的現象。」
目前住院醫師適用勞基法，工時控管將於法有據，輪班制工時上限13小時、必要延長3小時；非輪班制分為值班日與非值班日，值班日工時25小時、必要延長3小時，非值班日工時10小時、必要延長2小時，每4週工時不可超過320小時，延長工時另外計算加班費。
台北市醫師職業工會秘書長廖郁雯：「工時的部分雖然沒有實質下降，但是有明確規範出什麼叫作正常工作時間，什麼叫作延長工作時間。」
不過令業界憂心的是，工時受到控管，住院醫師恐怕訓練時數不足，也可能影響對患者的照顧。
康寧醫院教學副院長尹長生：「不管是臨床、住院醫師自己該做的事情，跟他當學生該學的東西全部都要連在一起的話，既然是責任，又要受訓，很難兩全其美。」
另外，目前主治醫師未納入勞基法，沒有工時保護，也就是說，未來的值班人力缺口，可能要由主治醫師補上。
康寧醫院教學副院長尹長生：「現在很多地方就是，如果按照嚴格的規定，住院醫師的工時完畢之後，都是主治醫師幫忙，所以很多主治醫師做住院醫師的工作，所以現在很可能缺一角，這一角就是要『住院主治醫師』來幫忙。」
預估這波適用勞基法的受僱住院醫師，不包含依公務人員法制進用者，約有4680人，雖然相較全台執業醫師人數約4萬8000人，仍不到10分之1，但已推動勞權觀念提升，2年多的法制化歷程，就增加4家醫院企業工會、4個產業工會。
台北市醫師職業工會秘書長廖郁雯：「台灣大概有將近500間的醫療院所，但是有企業工會的組織大概是10幾間左右，所以這工會的組織率是非常非常低的。」
隨著住院醫師納入勞基法，勞動意識已逐漸抬頭，未來適用範圍是否再擴大，主治醫師能否同樣受到保障，端看實際上路的後續情形。
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