雖然BNT疫苗供貨量逐漸穩定，但台灣現在還是有疫苗不足的問題，最棘手的莫過於已經打了第一劑莫德納疫苗的民眾，間隔時間已經到了但仍苦苦等不到第二劑的消息，就怕疫苗接種計畫進度延遲，指揮中心也加速著手疫苗混打的本土研究。
小小的這一瓶，裏頭裝的就是BNT疫苗，等等還不能打，冷凍濃縮原液得先均勻搖晃後，再用1.8ml無菌生理食鹽水注射。
診所醫師林應然:「把生理食鹽水打進去後，把空氣稍微再反抽回來。」
診所醫師林應然:「混打高端疫苗這事情這要從長計議，而且一定要有充分證據，才可以去執行。畢竟高端是我們台灣獨有，反而是AZ疫苗混打莫德納疫苗、AZ疫苗混打BNT疫苗，或是莫德納疫苗混打BNT疫苗是比較有經驗的，已經在執行一段時間的，這種應該要加速給它通過去混打。」
目前正在施打的，包含AZ疫苗、莫德納疫苗、BNT疫苗、高端疫苗還有流感疫苗，同時有5種疫苗在全台進行施打，但可不是都足夠。隨著BNT疫苗供貨量的穩定，AZ疫苗也靠著各國捐贈及自購，陸續進入第二劑施打。但看看莫德納疫苗庫存快見底，108萬只能稍稍稍微解渴，還有上百萬人在苦苦等第二劑，指揮中心也加緊腳步準備備案。
台大兒童醫院小兒部主治醫師24日在臉書號召參與「疫苗接種後抗體濃度臨床試驗」，當中包含四組成員，「AZ疫苗-莫德納疫苗」、「AZ疫苗-BNT疫苗」、「高端疫苗-BNT疫苗」及「高端疫苗-高端疫苗」，而就在千呼萬喚後，莫德納疫苗對BNT疫苗也列入其中。
台大兒童醫院小兒部主治醫師李秉穎:「不得已的時候去進行混打，你打了甲疫苗，然後甲打了以後出現嚴重過敏反應，或是其他嚴重不良反應，那他第二劑必須要採取其他疫苗，來第二劑的完成這是一個情況，第二個情況就是你打了第一劑疫苗以後，那甲疫苗缺貨或是供貨延遲，那時間是可以接第二劑疫苗，這兩個情形我們才會考慮混打，目前是滿踴躍(參與試驗)的，所以大概不久以後就可以收樣完成。」
不只台大醫院，長庚醫院等也陸續投入，儘管首批BNT疫苗專給第一劑施打，但混打研究也要同步加快腳步，才能解決台灣正面臨的三大困境。
隨著病毒變異，疫情還在全球延燒，如今行政院喊出10月底前，第一劑可超過七成，第二劑可上看三成，著眼全台疫苗的接種，不只跟病毒競逐也是在和時間賽跑。
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