各大醫院落實手術、住院要核酸檢測PCR篩檢陰性才能進行，但有民眾向媒體投訴，即使是門診手術，院方仍要求須自費PCR採檢，1人約4500元，有人陪病就要花9000元，覺得台北市現在還有7家醫院開放免費PCR，有的卻要花費近萬元，抱怨各醫院標準不一。
民眾抱怨收費不合理，指揮官陳時中則強調，中央只有要求，住院病患跟陪病者要做PCR採檢。
疫情指揮中心指揮官陳時中：「住院的本人跟陪病的本人，陪病的人，在防疫上需要，要求做PCR採檢，那這些都用公費來提供，至於在門診或門診手術，並沒有防疫要求。」
各家醫院的防疫要求不同，指揮中心尊重，但必須要病人先同意。
而指揮中心周六宣布，24日開始，包括加護病房、呼吸照護病房等特定病房，或住院七天以上病患，都開放探視，親友必須提供3天內的陰性報告，或居家快篩證明，部分醫院也認為居家快篩認定有難度，似乎再度跟中央不同調。
指揮中心醫療應變組副組長羅一鈞：「目前我們針對探病的部分，比如說是用抗原快篩，或是PCR檢驗結果都可以，醫院可能針對PCR要求，也要考量民眾的方便性，所以有具體的案例，就是說他堅持要求一定要PCR的話，可能要報請主管機關同意，才可以做這樣子的要求，目前我們的指引來講，我們是兩者有一個就可以。」
指揮中心強調，院方如果不接受居家快篩需要報請主管機關同意，建議民眾能拍照，或直接把快篩結果帶到醫院驗證，新規上路後，也考驗醫療體系的配套，能否更完善。
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