台南市長賴清德將北上接閣揆，最大難題就是要如何跟蔡總統磨合，因為兩人的個性都是比較堅持己見，立委就點出未來兩位強勢人硬碰硬，政治議題火花恐怖會不少，尤其現在總統總被認為是政策的主要領導者，因此外界也分析賴清德所屬於的新系，可能將會針對閣揆權力議題做攻防，希望行政院長可以制衡總統。
賴清德市長稱謂要換成「賴院長」，得迎接的挑戰首要就是怎麼跟蔡總統合作無間，蔡英文、賴清德兩人都是硬脾氣，會不會硬碰硬，考驗蔡賴兩人。
國民黨立委曾銘宗：「兩人個性都非常強勢，所以我認為未來的政局不會太安定，院長變成消費品，過去扁政府8年用了6位的院長，但是院長假設不了解情況，要跟總統硬幹的話，我認為輸的還是院長。」
點出蔡英文對於政策的掌控性高，被質疑職權一把抓，內閣等於沒實權，總統權力是不是該釋出一點？賴清德屬於的新系早有攻防。
立法院副院長蔡其昌：「如果有人正式去主張一些憲政上的議題，我想有人講了之後社會才值得去討論去回應，內閣制跟總統制的討論大概我從第二屆35歲近來立法院，已經討論到現在。」
賴清德長期耕耘台南，台獨議題早些年沒爭議，只是步步接近中央，想走中間路線，說出兩岸求同存異引發爭議，兩案論述總被打臉，甚至傳出一開始內閣要找的是高雄市長陳菊。
高雄市長陳菊vs.記者：「（身體不好理由推掉對不對？）沒有不是，需要優秀的人，那賴清德是我見過，新的世代之中最有擔當、最有勇氣、能力最好，我認為由他來承擔，沒有誰比他更適當。」
賴清德的難題不少，以前在地方跟議員吵架，選民吃這套，但未來到了立院，如果還是跟立委硬碰硬，恐怕沒成效反被酸。
國民黨立委李彥秀：「（賴清德）在台南市議會的性格，如果轉到立法院來，我相信接下來可能國會的火爆場面可能會很多。」
賴神北上掌內閣，行政處事都得調整，轉換成中央模式。
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