台南知名的林百貨，屬於古蹟，不過文資團體抗議，比他更早興建的菊元百貨，北市府卻只認定是歷史建築，不算古蹟，導致保存上會遇到困難，文化局回應，因菊元百貨結構改變，專業評定後先給歷史建築的身分協助保存。
1932年日本時期建立的菊元百貨，是全台第一棟，不是古蹟，比它晚成立的台南林百貨卻被認定是古蹟，引發文資團體不滿。
文史工作者凌宗魁：「加了一層玻璃帷幕的外牆，但是完全無損於梁柱、樓板、結構。」
台北大學都市計畫研究所教授郭肇立：「(歷史建築在)我們的文資法，沒有任何的保護作用，隨時你拆掉，罰個七萬塊就解決了。」
當初郭教授2015年夏天左右，進入菊元百貨舊址玻璃帷幕內，是日治時期白色立面牆磚，樓梯也是舊結構，有部分加新鋪面，內部、樑柱保存完好，還可看見當時廚房格局，菊元百貨被訂為歷史建築，惹來批評。
民進黨立委姚文智：「(北市府)能夠透過公開透明的程序，在重新進行一次文資的鑑定。」
歷史建築破壞有行政罰鍰，建築保存方式多樣，古蹟破壞有刑責，必須要依原貌修復，規定比較嚴格，文化局出面澄清，也是為了保存古建築。
北市文化局副局長田瑋：「整修的很厲害，它所謂的挑高空間完全不存在，有一個身分以後，其實國泰建設以後，它就不能隨意的修改建，要經過文資會的審查。」
文資審議委員會一共21個委員，採共識決認定屬於歷史建築，歷史建物怎麼認定，文資團體和文化局審議委員依照現有規模，認定各有立場。
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