提升高等教育，教育部喊出5年500億計畫，目前正在第二期，接下來民國106年要推動第三期，只是近期教育部拋出經費縮減，從1年100億可能變成砍半的想法，引發外界爭論，認為這樣一來將導致高教人才崩盤，品質崩壞的狀況，而最直接影響就是正在進行中的「頂大研究專案」，恐怕得面臨經費斷炊。
陽明大學臨床醫學研究所教授楊慕華：「它其實具有很多觸角，代表這個癌細胞具有高度侵犯性。」
螢幕中展示的3D細胞模擬，楊慕華花了4年才得出結論，這是「頂大計畫」支持項目之一。陽明大學臨床醫學研究所教授楊慕華：「將來要去治療的應該是去阻斷由Snail(轉錄因子)，引發的巨噬細胞，吸引之間的作用。」
研究數據一年比一年有最新突破，同樣有「頂大計畫」支持，中央大學研發的「太空魔方」，號稱全球最輕、最小，取樣率最高的先進電離層探測儀，明年第一季還會隨著福衛五號升上外太空，至於陽明大學還有一個研究專案，發現毛髮可以刺激再生，透過適當密度拔毛，誘發毛囊活化，甚至能長出5倍數量的毛髮，只是這些計畫在5年500億進入第三期後，可能面臨經費難產的困境。
教育部次長陳德華：「因為這幾年來，整個從100億減到85億、75億，原則上大概那個趨勢上面，維持100億的可能性，大概是沒有啦，大概是沒有，因為整個來說，在過去的前面10年中，有相當大的比例，用在所謂基礎建設，(未來)重點會擺在偏重於軟體方面，會縮到多少，還要看整體資源的配置。」
教育部拋出最新立場，引發不小的震撼彈，中山大學校長黃志青認為，一年100億已經是最起碼的規模了，如果經費再減少，人才恐怕會崩盤，而中興大學校長李德財則是說經費向來重北輕南，以往都是北部學校拿了75億，剩下25億才由南部學校均攤。
實踐大學校長陳振貴：「大概1年至少要出100億，這是一個共識，那現在一下子減少了，真的是對他們來講，我沒有這麼悲觀說他們一定會崩盤，但是對他們的擠身世界百大，在這種國際學術聲望提升跟維持，我相信有負面影響。」
政大國發所所長童振源：「浙江大學它1年預算72億人民幣，那麼政大的預算1年只有40億，所以他們將近我們的10倍，那麼北京大學1年的研究經費，就大概相當於全台灣的5年500億，所以你可以看到說，以目前來看台灣的教育資源太有限。」
對於經費資源分配不足，老早已經替台灣高教埋下教學品質低落的危機。政大國發所所長童振源：「國外的著名學者，他們事實上不願意到台灣來，很多畢業的學者也不願意畢業後到台灣來就業，所以譬如說台大財經系，過去3年沒有聘到好的老師，連台大財經系都聘不到，更不要講其他的學校。」
陽明大學臨床醫學研究所教授楊慕華：「1年大概至少也要150萬吧，因為你全職的博士後研究員，再加上研究助理再加上每個月的耗材，大概是需要的。」
沒有教育部當後盾，進行中的研究專案恐怕走不下去，但面對高等教育的未來，高教評鑑中心董事長黃榮村就認為，教育部 應該減少頂尖大學數量，集中火力去發展「頂大中的頂大」，只是爭議並不會因此減少。
政大國發所所長童振源：「台灣的經費資源全部集中在台大，並沒有解決台灣普遍的教育問題，也沒解決台大競爭力的問題，你看到說台大事實上只不過生產出一些國際上期刊的東西，對整個國家的貢獻，對於整個學生的培養，並沒有非常顯著的一個進步。」
培養頂大、搶國際排名，跟提升高教品質怎麼兼顧平衡，這恐怕還是教育部要先搞清楚的問題。
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