復興航空班機在澎湖失事，如果從當時馬公機場的天氣觀測報告來看，在最關鍵的6點半到7點10分，風向、風速至少變了3次，尤其7點到7點10分，風向從「南南西風」變成吹「西南西風」，側風多了30度，飛行教官說，如果是10分鐘內「慢慢」改變，一般機師還能控制，但就怕這風向是不到1分鐘內突然轉變，再加上如果準備降落時碰到下沉氣流，種種原因碰在一起，很可能就會發生危險。
飛機進場標準，一定得參考機場天氣觀測報告，這是馬公機場23日晚間的詳細氣象資料，密密麻麻的英文字母和數字，稍微解讀就發現，當時天氣劇烈變化，RCQC是馬公機場的代碼，231100Z是格林威治時間23日11點，台灣要加8小時，也就是晚間7點鐘，22011G21KT代表當時吹的是220度的南南西風，風速11海浬，最大陣風21海浬，相當於5級風，能見度是符合20跑道進場條件的1600公尺，飛機要降落了，偏偏天氣突然劇烈變化，7點06分，發現進場姿態不對，要求重飛，08分卻已經失事。
如果再從7點10分氣象改變，另加觀測資料來看，風向從220度變成250度的西南西風，風速從11變成18海浬，陣風也從21海浬變成28海浬，等於從5級風突然變成7級，能見度也降到只剩800公尺，已經低於馬公機場20跑道的進場條件，這麼短時間內的風向改變，專家說這表示有不穩定的對流系統。中華航空觀光發展協會教官祝長毅：「21浬到28浬，一般來講 風速(變化)比較大一點，側風會比較大一點。」
當時颱風雷雨帶卡在台灣海峽，積雨雲大大影響了馬公機場的能見度，從下午3點半能見度2400公尺，幾乎每10分鐘或半小時就產生變化，復興航空失事後兩分鐘，觀測到的天氣資料，能見度也只剩800公尺，不能降落，但比它早降落的兩架航班，準備進場時的能見度，一個從2400公尺變800公尺，一個是1600公尺，幸運的是風速風向沒有劇烈改變，但復興航空不只能見度銳減，似乎還碰上不穩定氣流。民航局副局長李萬里：「我想民航局責無旁貸，會把所有標準再重新檢視一遍。」
還有飛安會參與失事調查的人員透露，從飛機殘骸發現，重飛時，飛機應該收起來的襟翼和起落架都沒收起來，不排除機師才向塔台提出重飛，就突然遭遇下沉氣流，但飛安會強調，一切還是得等黑盒子解讀，失事原因才能更明朗。
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